Di sesi latihan bebas ke-2 Grand Prix Aragon, Marc Marquez berhasil menjadi yang tercepat, seperti yang ia lakukan sepanjang sesi Jumat. Dengan mencatat waktu terbaik 1:46,607 di lap terakhir sesi, Marquez berhasil melewati 14 lap dengan ban bekas. Penggunaan kombinasi ban depan medium dan ban belakang soft pada awalnya, kemudian menggunakan ban medium dan medium lagi untuk 22 dan 20 lap mendekati jarak balapan. Ia berhasil memperbaiki catatan waktunya hingga mendekati waktu 1:46,397 yang ia capai pada Practice Jumat sore. Namun, dominasi Marc Marquez tak terbendung, karena para pembalap Ducati mencatat putaran tercepat di awal sesi dengan waktu 1:46,46.
Sementara itu, adik sekaligus rival utama Marc, Alex Marquez, mengalami kecelakaan dengan 9 menit tersisa di sesi tersebut, menjadi kecelakaan kedelapan di musim ini dan menempatkannya di urutan ke-10. Di urutan kedua dalam catatan waktu adalah Pedro Acosta, yang berhasil mendekati Marquez hingga berjarak satu setengah detik di akhir sesi dengan menggunakan ban depan keras dan ban belakang lunak, diikuti oleh Franco Morbidelli di posisi ketiga dan Maverick Vinales di posisi keempat.
Di sisi lain, Fabio Quartararo berhasil memperbaiki catatan waktunya dan meskipun Yamaha tampil buruk pada hari Jumat, namun Quartararo berhasil finis di urutan kedelapan. Namun, Joan Mir dari tim Honda mengalami kecelakaan di akhir sesi, mengakhiri catatan waktunya di posisi ke-12 dengan kerusakan parah pada motornya, meski tidak mengalami cedera fisik.
Secara keseluruhan, Marc Marquez kembali menunjukkan dominasinya di MotoGP Aragon dengan catatan waktu tercepat di FP2, sementara pembalap lainnya juga memberikan penampilan yang menonjol. Menyusul hasil FP2 ini, semua mata tertuju pada kualifikasi berikutnya dan siapakah yang akan memimpin di Grand Prix Aragon selanjutnya.